„MiLaboratories“ gauna 10 mln. USD už platformos žaidimą, kad paspartintų genominius tyrimus

DNR sekos nustatymo pažanga ir didžiulis genominių duomenų kiekis, gaunamas naudojant naujos kartos sekos nustatymo (NGS) technologiją, sukūrė paleidimo galimybę sukurti programinę įrangą biologams, kad jie galėtų lengviau analizuoti šiuos didelius duomenis ir žengti kitą šuolį. Tai gali padėti kuriant naujas vakcinas, vėžio gydymą ir pan.

Pastaruosius ketverius metus „MiLaboratories“, San Franciske įsikūręs startuolis, turintis tyrimų ir plėtros centrą Bilbao, Ispanijoje, kūrė kompiuterinės biologijos platformą, kad biologams būtų lengviau apdoroti, analizuoti ir kaupti savo duomenis. Jame yra tokių funkcijų, kaip duomenų vizualizavimas ir generuojantis dirbtinis intelektas, kad pagerintų naudojimą.

Jos platforma taip pat sukurta kaip rinka kitiems mokslininkams, kad jie galėtų platinti labiau specializuotus skaičiavimo įrankius programų pavidalu ir toliau plėsti naudingumą genomikos tyrimų bendruomenei. „MiLaboratories“ yra skirta mokslininkams, kurių įgūdžiai apima biologiją, kompiuterių mokslą ir matematiką – vadinamuosius bioinformatikus.

„Biologams tai yra „be kodo“ stiliaus metodas ir taip pat išleidžiame (atvirojo kodo) SDK – programinės įrangos kūrimo rinkinį, leidžiantį bioinformatikams kurti tikras programas“, – „TechCrunch“ pasakoja generalinis direktorius Stan Poslavsky.

„Per savo ir mūsų įkūrėjų mokslinę karjerą matėme didžiulį neefektyvumą. . . kaip kuriami šiuolaikiniai gydymo būdai, kaip modernūs vaistai“, – aiškina jis. „Dėl šios trinties tarp duomenų – didelių duomenų, kuriuos generuoja biologai, sekos nustatymo duomenų – ir duomenų analizės, kuri jiems nėra prieinama.

Nors yra „tūkstančiai“ programinės įrangos programų ir įrankių, galinčių atlikti NGS duomenų analizę, jis sako, kad dauguma jų buvo sukurtos akademinėje bendruomenėje, kur daugiausia dėmesio skiriama naudingumui, o ne tinkamumui.

Biologai taip pat turi apibendrinti ir integruoti kelių analizių rezultatus, sako jis. „Vieningame paveiksle, leidžiančiame suprasti, kas vyksta. Ir čia mūsų platforma labai padeda“, – siūlo jis.

Startuolis tikisi, kad jo platforma išlaisvins bioinformatikus nuo įkyraus genominių duomenų apdorojimo darbų, kad šie daugiadalykiai mokslininkai galėtų pritaikyti savo įgūdžius sudėtingesnėms algoritmų kūrimo užduotims, kurios gali padėti tobulinti pažangiausią mokslą.

„Bioinformatikai iš tikrųjų praleidžia daug laiko tiesiog dirbdami beždžioniškai, kurdami biologams skirtą programinę įrangą“, – sako Poslavskis. „Norėdami apdoroti šiuos duomenis, turite turėti Linux mašinas, pereiti per SSH, paleisti sudėtingus programinės įrangos įrankius, kad būtų atlikta analizė ir gautumėte įžvalgų iš duomenų.

„(Gydytojas) neturi įgūdžių tai padaryti „Linux“, HPC (didelio našumo skaičiavimo) klasteryje, nes jis turi kitų dalykų. Ir tai, ką dauguma įmonių ir akademinės bendruomenės bioinformatikų atlieka tik šį mėnesinį įrankių valdymą.

Ketvirtadienį „MiLaboratories“ oficialiai atsisakė savo SDK „Platforma.bio“, leidžiančio trečiųjų šalių kūrėjams prisidėti prie programų, nors jau kelerius metus ji buvo bandoma alfa ir beta versijose. (Poslavskis sako, kad „apie 300 laboratorijų“ naudojo beta versiją, o platformoje iki šiol buvo pasiekiama „apie 20“ programų.)

„Pirmosios programos, kurias galima rasti platformoje, yra sukurtos remiantis mūsų biologinėmis ir bioinformatinėmis programomis, kurios yra labai populiarios. . . (su) įmonėmis ir žmonėmis, dalyvaujančiais imuninės terapijos kūrime. Bet mes jau turime. . . geras pasirinkimas bendradarbiavimo ir žmonių, norinčių pateikti savo programas platformoje, tiek iš akademinės bendruomenės, tiek iš pramonės“, – priduria jis.

2021 m. įkurtas startuolis taip pat skelbia 10 mln.

„Pagrindinė pinigų pritraukimo priežastis yra tiesiog daugiau rankų prisidėti prie mūsų platformos kūrimo. Samdome daugiau inžinierių. Mes samdome vadinamuosius kūrėjų advokatus, kurie skleidžia technologiją aplink – pirmiausia – akademinėje bendruomenėje, nes dauguma bioinformatikos programinės įrangos kuriama akademinėje bendruomenėje.

„Ateinančiais metais (mes) daugiausia dėmesio skirsime technologijų sklaidai bendruomenėje ir bendruomenės įtraukimui kurti savo programėles, apvynioti esamą programinę įrangą ir pristatyti jas per platformą“, – priduria jis.

„MiLaboratories“ serijai A vadovauja Madride įsikūręs Kfund, dalyvaujant Acrobator Ventures, EGB Capital, Courtyard Ventures, Somersault Ventures, Speedinvest ir Ten13.

Komentuodamas savo pareiškimą, generalinis Kfund partneris Miguelis Ariasas sakė: „Mes norime daryti svarbiausią dalyką – investuoti į platformas, kurios užpildo atotrūkį tarp kūrėjų (šiuo atveju bioinformatikų) ir verslo vartotojų (šiuo atveju biologų). mūsų fonde. Yra didžiulis potencialas demokratizuoti prieigą prie sudėtingų duomenų, leidžiančių pateikti imunologines įžvalgas.

„MiLaboratories“ siūlo savo programinę įrangą akademikams nemokamai, tačiau ji taip pat gauna pajamų iš mokamo modelio, skirto komerciniams vartotojams. Poslavsky teigimu, šiame etape startuolis artėja prie 100 mokančių klientų.

„Daugelis didžiųjų farmacijos kompanijų – pavyzdžiui, „Moderna“, „Bristol-Myers Squibb“ – yra mūsų klientai“, – pažymi jis ir priduria: „Turime pajamas – geras pajamas – todėl negalime būti taip priklausomi nuo rizikos pinigų.

2022 m. pradžioje startuolis surinko 2,5 mln. Anksčiau ji taip pat paėmė mažą išankstinę sėklą iš kelių angelų.

Aptardamas skaičiavimo biologijos platformos kūrimo iššūkius, Poslavskis sako, kad stulbinantis NGS generuojamų duomenų kiekis reiškia, kad startuolis turėjo skirti labai daug dėmesio apdorojimo efektyvumui užtikrinti, kad išvengtų „beprotiškų išlaidų“.

„Erdvėje sugeneruotų duomenų kiekis iš tikrųjų yra beprotiškas“, – pabrėžia jis. „Didelės farmacijos įmonės, mūsų klientai. . . iki šiol jie turi petabaitų genetinių duomenų. Taigi tai didžiulis mastas.

„MiLaboratories“ sukūrė tai, ką Poslavskis laiko „labai sudėtingą“ ir „matematiškai patikrintą“ technologiją, kuri leidžia „labai optimizuotai“ atlikti įvairius skaičiavimus. Jis siūlo, kad ši technologija, kurią ji patentavo, leidžia platformai pasiekti 10 kartų didesnį efektyvumą, palyginti su kai kuriomis kitomis skaičiavimo darbo eigos rūšimis.

„Tai labai svarbus dalykas. Tai paslėpta nuo biologo akių, nes vertingas pasiūlymas biologui yra „noriu spustelėti mygtukus ir gauti įžvalgos“, tačiau tai labai svarbu verslo savininkams.

Kalbant apie konkurenciją, Poslavskis įvardija „Seqera“ (ir jos „Nextflow“ programinę įrangą) kaip artimiausią konkurentą – pagal populiarumą ir vertės pasiūlymą. Taip pat yra atvirojo kodo įrankių, skirtų NGS apdorojimui, pvz., „Galaxy“, tačiau „MiLaboratories“ mano, kad jos platforma siūlo tyrėjams labiau prieinamą kelią į duomenų įžvalgas.